民眾黨中央委員張凱鈞日前投書媒體，指南市孔廟文化基金會執行長石牧民「無視文資法相關規範，未經申請就強拆孔廟」。張凱鈞指出，「財團法人台南市孔廟文化基金會」為台南市政府所轄，相關營繕工程須透過政府制度上網公告發包，經費預算也需經市府與議會審查，但他卻未見任何的申請核可且未上網公告發包，因此認為南市府帶頭違法文資法與政府採購法。
針對相關控訴，孔廟文化基金會強調指控絕非事實，相關修繕工程完全依照文資法規範報請同意，現場也有相關安全防護措施。「特定政治人物為圖選舉利益，未經查證即對本會進行惡意攻擊，是對社會大眾做出最惡劣示範，本會對此表示遺憾。」
文化局今（14日）表示，台南孔廟當前正在進行「台南孔廟販賣部泥屋面天溝瓦作修繕工程」，依據《文資法》相關規定，今年10月6日檢送計畫書向國定古蹟主管機關「文化部文資局」申請，並獲同意。於工程施作期間，也規畫放置相關安全措施和護欄，以維護來訪遊客與施工團隊安全。
此外，孔廟販賣部施作部分，僅為更新販賣部內部商品展示櫃，相關往返公文俱在。張文所言「強拆孔廟」不僅昧於事實，未負起查證責任，更對台南市孔廟文化基金會造成嚴重傷害。
至於投書內容中指稱台南市孔廟文化基金會執行長遴選程序與現任執行長石牧民所提相關質疑，文化局也強調，基金會執行長遴選過程秉持公平、公正與透明的原則舉行，市府也針對議員及外界質疑逐一回答，並去函國立台灣文學館求證，台文館則函覆指出石牧民當時於台文館工作的出差勤皆依規定辦理，文中所言絕非事實。
