國民黨副總統候選人趙少康日前在青年座談提到兩岸議題時，表示若當選會要求中共不要再讓共機飛越海峽中線、戰艦不繞台，要求中國讓台灣觀察員駐中，減少對台飛彈部署等。此外他也稱台灣也要準備3道防線，包括源頭打擊、海上殲滅、灘頭阻擋，還要大量製造飛彈，能造多少造多少，若遭中國攻擊，我們也能回擊。
對趙少康言論，今邱國正被問及此事，表示選舉議題他沒有意見，並稱國軍戰備訓練是本務，不會因為環境變化改變，軍事是政治的延長，很多議題政治若沒有搞定，軍事不可能有逾越行為。
邱國正強調，自己就趙少康個人論調都沒有意見，很多專家學者都有立論基礎，但基礎怎麼來國防部從未跟任何人討論，永遠的基礎工作就是戰訓本務。媒體再追問是否已經大量製造飛彈？邱國正則稱沒有，指飛彈是平常戰備工作之一，沒有因哪個階段特別凸顯，他也重申自己沒有評論、不太了解，強調「避免戰爭是大家共同的期望」。
此外有媒體報導，一名商人謝秉成接受中共軍情人員指示返台建立共碟網路，吸收多名軍官，其中航特部謝姓中校及花防部何姓少校更涉嫌將機密的「國防軍事會談」會議及「固安作戰計畫」翻拍給對岸。此外中共還策動謝姓中校搭直升機降落在中共航母上投共，承諾成功的話支付1,500萬美元（約新台幣4億7,249萬）鉅款等。
對此，邱國正今受訪則表示，這幾年中共對我們有很多動作，拉攏我們的人，嘆「的確受到蠻大的影響」，邱國正稱，國軍早期有在強化保防教育，也有許多個案是他們自己發掘送辦，同時也會做損害管控等。
邱國正強調，國軍的做法是一定不會隱而不報或藏私，茲事體大一定交給法辦，用意是展現國軍不會隱匿、不會吃案，其他同步損害管控也會做。
