對於海巡署執行執法過程未能蒐證一事，外界質疑隱匿影片並非事實，本案執法過程中因高速追逐狀況，船身受海浪影響劇烈晃動，同仁須高度專注維持平衡，加以本案發生僅歷時5分鐘，故因高速追逐及時間短暫等因素，致該名負責蒐證同仁未即拿取蒐證器材（手持式攝影機）進行蒐證。
本案因未有全程蒐證影像，因此導致家屬無法很快地了解事實真相，沒能讓家屬能夠安心，也讓社會有很多爭議感到抱歉，海巡署已積極配合檢方調查，相信司法機關的調查程序必定可還原事實，未來海巡署會將本案作為勤務上精進，亦將加強相關教育訓練及律定作業程序。
海巡署現有CP艇現無裝設全船監視系統，依據海巡署配備基準，是類小艇亦未配備密錄器，導致同仁未使用密錄器，未違反相關規定，惟倘有密錄器使用，縱然無法拿取手持式攝影機，亦能避免本次無法蒐證的情況發生，未來針對該型艇出勤時，將全數補足船上4名執勤同仁足額密錄器。
本案取締該艘越界快艇為海巡署日常執法任務，本案係雷達發現該陸籍快艇越界後，第十二巡防區即通知CP-1051艇前往實施取締，這是一個執法案件，春節前金門海域即有許多是類快艇在周邊海域作業，海巡署不斷接獲民眾報案，必須依法取締，以符人民期待，本案為執法作為，並無上級特別指示或其他考量，純屬海巡日常執法行動。
為使大眾了解事件始末，海巡署特提供案發時該海巡艇與第十二巡防區之無線電通聯錄音檔。本事件不幸造成2名陸籍人員死亡，對死者家屬的傷痛，我們同體大悲，亦不樂見其發生，本案已接受檢察官調查，希望全案回歸執法個案，不要升高衝突，更希望擱置政治，人道優先，期待能儘速完成善後，讓死者安息，生者安心。
