黃曙光晚間發表請辭聲明，他表示個人在大選期間，基於國家安全的思考，希望不要再有政治爭議，傷害國防戰力的提升，或者是有不負責任的言論自由，分化傷害人民的感情，才決定辭去工作。
他也強調，潛艦國造案是歷任總統的政策，全案均依法依約執行，但他在這近7、8年的時間，承受不了不實指控、嚴重誹謗及攻訐，意圖混淆國人認知，更無法忍受有心人士破壞國防戰力的提升、打擊詆譭軍人名譽與士氣，這些個人利益置於國家利益之上，敗壞社會風氣影響深遠，自己不能苟同，因此正式提出告訴以正視聽。
黃曙光表示，請辭是個人身心俱疲，完全與他人無關，更無關任何政治因素，未來他也會以民間人士身分，協助台船與海軍造艦提供各項諮詢參考。黃曙光同時呼籲，希望有心名嘴、特定學者與政治人物要以國家為念，不要再用媒體做不實報導，也不要分化和製造人民與政府的對立，更勿惡意攻擊、敗壞社會風氣或打擊軍人的名譽與士氣，「否則國家的未來堪憂！」
